169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08420 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  865    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  33.48 
 
 		 459 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  33.11 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  32.92 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  32.48 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  30.8 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  32.08 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  32.7 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  30.93 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  30.93 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  30.93 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  32.36 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  28.51 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  35.53 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  28.08 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  30.37 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  28.38 
 
 		 430 aa  86.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  27.96 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  27.39 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  23.32 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  23.23 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  29.41 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.86 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  27.94 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  28.98 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.94 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.03 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  42.19 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  34.15 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  31.78 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  31.68 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.93 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.91 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  37.1 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  32.08 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  30.63 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  31.68 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  44.83 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.08 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.06 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 		 505 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  36.78 
 
 		 312 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  30.82 
 
 		 317 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  28 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  26.34 
 
 		 304 aa  53.5  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  30.13 
 
 		 641 aa  53.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  29.89 
 
 		 318 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  30.37 
 
 		 652 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  35.38 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.82 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  40.62 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  27.01 
 
 		 828 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  27.43 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  24.61 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  35.71 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  35.71 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  35.71 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  40.62 
 
 		 351 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  37.29 
 
 		 303 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  39.34 
 
 		 341 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  35.29 
 
 		 336 aa  50.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.08 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  37.29 
 
 		 303 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  32 
 
 		 317 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  26.05 
 
 		 286 aa  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  35.59 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  40.98 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.95 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  24.57 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  32.84 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.23 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  35.82 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.8 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  33.85 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  24.07 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  41.94 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.38 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.87 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  38.33 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  24.74 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  24.72 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  33.91 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.94 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 		 638 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  33.91 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  35.59 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  26.97 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  31.71 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  27.14 
 
 		 391 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  45.1 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  25.89 
 
 		 318 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.02 
 
 		 288 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>