218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2419 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
638 aa  1253    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  49.92 
 
 
638 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  47.63 
 
 
528 aa  349  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  48.09 
 
 
448 aa  348  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  35.17 
 
 
652 aa  327  6e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  35.57 
 
 
684 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  43.67 
 
 
469 aa  312  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  37.33 
 
 
641 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  40.84 
 
 
451 aa  290  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  36.85 
 
 
505 aa  260  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  36.51 
 
 
445 aa  223  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  40.48 
 
 
828 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  34.45 
 
 
436 aa  193  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  37.65 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  31.7 
 
 
530 aa  181  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  36.39 
 
 
546 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  31.09 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  30.87 
 
 
419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  30.49 
 
 
419 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  25.27 
 
 
391 aa  98.6  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 
520 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  28.26 
 
 
404 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 
434 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  30.59 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  31.02 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  33.05 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  28.88 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  28.88 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  29.1 
 
 
467 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  28.16 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  29.3 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  28 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.96 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.23 
 
 
444 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  28.53 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.41 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  32.19 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  31.86 
 
 
446 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.95 
 
 
302 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.84 
 
 
458 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  28.76 
 
 
435 aa  64.7  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  26.17 
 
 
440 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.35 
 
 
444 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.09 
 
 
432 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.58 
 
 
436 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.59 
 
 
308 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  27.97 
 
 
423 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  29.09 
 
 
443 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
430 aa  61.6  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  29.32 
 
 
287 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  25.38 
 
 
440 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.58 
 
 
287 aa  60.8  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 
292 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.52 
 
 
290 aa  60.8  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.36 
 
 
444 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.59 
 
 
431 aa  60.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.56 
 
 
286 aa  60.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.18 
 
 
443 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.69 
 
 
446 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  24.79 
 
 
296 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 
436 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.83 
 
 
404 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  32.35 
 
 
412 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  33.93 
 
 
447 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  31.86 
 
 
429 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
297 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.29 
 
 
404 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  33.16 
 
 
310 aa  57.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.25 
 
 
293 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.3 
 
 
295 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.11 
 
 
404 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.33 
 
 
328 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  34.17 
 
 
440 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.46 
 
 
288 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.67 
 
 
404 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  27.23 
 
 
312 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  29.89 
 
 
313 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  25.62 
 
 
331 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  23.92 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  21.78 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  23.85 
 
 
405 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  30.91 
 
 
291 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  24.56 
 
 
428 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  27.11 
 
 
450 aa  54.7  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  25.12 
 
 
330 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  30.53 
 
 
318 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  23.5 
 
 
401 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.93 
 
 
287 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.23 
 
 
404 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  32.43 
 
 
430 aa  53.9  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.66 
 
 
331 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  26.74 
 
 
459 aa  53.9  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  31.15 
 
 
444 aa  53.9  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  26.24 
 
 
310 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.14 
 
 
328 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  23.79 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.7 
 
 
293 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  36.28 
 
 
294 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.76 
 
 
291 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>