142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0400 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 505 aa  994    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  42.44 
 
 		 528 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  39.47 
 
 		 451 aa  286  7e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  38.31 
 
 		 684 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  41.24 
 
 		 641 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  39.31 
 
 		 448 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  36.44 
 
 		 469 aa  253  7e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  36.85 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  35.79 
 
 		 487 aa  230  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  37.64 
 
 		 638 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  33.7 
 
 		 652 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  40.83 
 
 		 828 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  35.08 
 
 		 530 aa  200  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  34.23 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  34.99 
 
 		 436 aa  197  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  32.9 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  35.47 
 
 		 546 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.62 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.42 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  25.9 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  28.02 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  25.55 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.21 
 
 		 442 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  26.03 
 
 		 444 aa  57  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  32.73 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.55 
 
 		 302 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  31.3 
 
 		 314 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  29.01 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.43 
 
 		 331 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.43 
 
 		 331 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.43 
 
 		 330 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  27.53 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  28.63 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  27.59 
 
 		 564 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  28.63 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  28.63 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  23.28 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  30.05 
 
 		 405 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  29.63 
 
 		 318 aa  50.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  21.2 
 
 		 405 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  28.45 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  24.36 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  34.69 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  26.2 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.14 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  24.36 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  25.11 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  21.24 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  33.68 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.46 
 
 		 291 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  20.4 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  23.93 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  21.48 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  21.48 
 
 		 404 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  24.33 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  26.21 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  24.36 
 
 		 317 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  29.07 
 
 		 320 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  31.12 
 
 		 392 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  24.36 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.61 
 
 		 295 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 		 297 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.31 
 
 		 432 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  21.09 
 
 		 404 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  46 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  24.27 
 
 		 309 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  36.22 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.17 
 
 		 314 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.78 
 
 		 308 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.8 
 
 		 323 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27 
 
 		 410 aa  47  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  24.07 
 
 		 459 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.17 
 
 		 314 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.08 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  39.06 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  22.55 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  26.45 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  37.66 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  27.39 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.96 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  23.24 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  37.5 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  38.24 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  36.11 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  21.09 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  22.58 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  20.7 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  20.7 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  42 
 
 		 241 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  27.5 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  26.09 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0416  hypothetical protein  43.75 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  26.78 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  27.51 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  43.1 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  42.86 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>