99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  859    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  45.91 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  48.45 
 
 		 455 aa  282  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  43.48 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  40.85 
 
 		 430 aa  230  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  39.29 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  30.21 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  29.37 
 
 		 467 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  28.11 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  31.28 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  30.37 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  30.67 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  29.88 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  32.85 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  29.64 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  28.67 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  29.73 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  29.73 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.23 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  26.82 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  28.78 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  27.1 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  29.49 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  29.71 
 
 		 652 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.72 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  21.38 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  29.1 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.04 
 
 		 287 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.27 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  27.46 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.79 
 
 		 290 aa  57  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  21.89 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.24 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.64 
 
 		 296 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  30.94 
 
 		 575 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  30.86 
 
 		 295 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.83 
 
 		 309 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23.67 
 
 		 295 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  26.82 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  28.06 
 
 		 528 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.83 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.14 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  29.41 
 
 		 469 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.93 
 
 		 288 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.11 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  23.35 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.2 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  21.97 
 
 		 287 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  27.64 
 
 		 546 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.64 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  28.03 
 
 		 317 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.7 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  24.33 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  31.94 
 
 		 308 aa  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  31.88 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  31.94 
 
 		 308 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 		 519 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  28.73 
 
 		 300 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  26.75 
 
 		 317 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.19 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.76 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.1 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  29.46 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  38.3 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.5 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.62 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  34.55 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.52 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  21.69 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.43 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  29.23 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  26.59 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  27.04 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  24.67 
 
 		 286 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  33.67 
 
 		 564 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  22.03 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  28.24 
 
 		 317 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  28.24 
 
 		 314 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  30.36 
 
 		 309 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  29.91 
 
 		 312 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  30.54 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  31.07 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  27.19 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  27.27 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  25.32 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.8 
 
 		 310 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.17 
 
 		 345 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  35.48 
 
 		 318 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  33.11 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>