88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1195 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  595  1e-169  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0416  hypothetical protein  50.68 
 
 
306 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  51.06 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  47.83 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  38.37 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  37.14 
 
 
241 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  37.63 
 
 
239 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  33.66 
 
 
391 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  47.37 
 
 
487 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  35.94 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  36.11 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  27.33 
 
 
336 aa  49.3  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  38.36 
 
 
411 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  45.83 
 
 
445 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  41.07 
 
 
561 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  38.89 
 
 
445 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.1 
 
 
421 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  46.81 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  44 
 
 
436 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  42.55 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  35.9 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  34.04 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  29.11 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  40.43 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  44.19 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  40.28 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  36.59 
 
 
546 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  35.23 
 
 
380 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  48.57 
 
 
326 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  36.96 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  37.66 
 
 
505 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  43.9 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.1 
 
 
431 aa  46.2  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  39.13 
 
 
442 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  32.81 
 
 
286 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  34.62 
 
 
422 aa  45.8  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  43.48 
 
 
308 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  34.62 
 
 
552 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
828 aa  45.8  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  41.86 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  27.72 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  36.17 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  38.78 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  36.96 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.74 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  40.43 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  34.55 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  47.92 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  34.55 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  38.3 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  34.55 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  41.3 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  39.13 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  41.18 
 
 
454 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  33.72 
 
 
430 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  39.13 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  36.96 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
434 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  36.96 
 
 
450 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  39.58 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  39.13 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  37.93 
 
 
410 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  39.13 
 
 
440 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  34.67 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  40.43 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  36.96 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  34.85 
 
 
424 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 
430 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  31.87 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  34.85 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  39.13 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  40 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  48.89 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  37.25 
 
 
473 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.96 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  39.13 
 
 
322 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  34.78 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  34.78 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 
375 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  25.68 
 
 
402 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  33.78 
 
 
434 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  35.09 
 
 
463 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  34.04 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  30.77 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 
296 aa  42.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>