154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0863 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
314 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  71.66 
 
 
318 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  55.52 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  55.52 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  39.49 
 
 
315 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  41.27 
 
 
352 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  38.21 
 
 
326 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  39.68 
 
 
357 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  39.68 
 
 
357 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  35.88 
 
 
317 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.2 
 
 
333 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  37.29 
 
 
344 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  35.58 
 
 
316 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  36.03 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  35.02 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  35.9 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  39.47 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.87 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  33.44 
 
 
344 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  30.9 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  34.56 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  34.95 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  33.97 
 
 
318 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  38.67 
 
 
346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  34.62 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  33 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  33 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  32.42 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  32.15 
 
 
341 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  33.23 
 
 
372 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  36.2 
 
 
362 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  32.61 
 
 
339 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  33.97 
 
 
317 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.08 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  31.5 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  26.16 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.32 
 
 
316 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.66 
 
 
316 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  31.95 
 
 
318 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  24.78 
 
 
353 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.23 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  27.21 
 
 
342 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.94 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  26.99 
 
 
417 aa  92.8  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.19 
 
 
329 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.93 
 
 
943 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.04 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  27.81 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.71 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  22.67 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  27.88 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  28.4 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.74 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  28.09 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  26.14 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  27.78 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.1 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.1 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  22.4 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.85 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  27.45 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  27.45 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.19 
 
 
552 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.4 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.01 
 
 
428 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.63 
 
 
325 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  30.22 
 
 
442 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  23.04 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  23.98 
 
 
401 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  28.45 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  32.85 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
384 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
384 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  35.04 
 
 
497 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  31.25 
 
 
424 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  35.24 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.1 
 
 
428 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.3 
 
 
294 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.44 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  24.56 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  30.63 
 
 
421 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  50 
 
 
436 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  34.11 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.23 
 
 
447 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
426 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  28.87 
 
 
386 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  26.92 
 
 
429 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  34.82 
 
 
436 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  31.97 
 
 
436 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.24 
 
 
391 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  33.09 
 
 
395 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  26.19 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  34.04 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  32.48 
 
 
564 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  34.21 
 
 
479 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  45.45 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>