241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1490 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  46.1 
 
 
344 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  39.49 
 
 
316 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  44.69 
 
 
317 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  41.67 
 
 
327 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  40.13 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  38.36 
 
 
321 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  43.04 
 
 
318 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  36.62 
 
 
349 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  38.59 
 
 
317 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  40.58 
 
 
318 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  37.46 
 
 
339 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.94 
 
 
333 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  40.48 
 
 
315 aa  185  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  38.58 
 
 
346 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  42.39 
 
 
318 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  37.22 
 
 
357 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  37.22 
 
 
357 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  37.69 
 
 
352 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  29.97 
 
 
323 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  39 
 
 
341 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  39 
 
 
341 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  36.96 
 
 
336 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  32.53 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  34.73 
 
 
323 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  35.22 
 
 
319 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  35.22 
 
 
319 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  36.01 
 
 
344 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  38.59 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  40.33 
 
 
318 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  29.45 
 
 
372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  31.37 
 
 
329 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  34.55 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  38.74 
 
 
314 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  30.82 
 
 
329 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  33.12 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  34.45 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  31.97 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  31.51 
 
 
338 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  33.11 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  29.91 
 
 
337 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  35.33 
 
 
339 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  28.48 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  32.8 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  27.87 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.08 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  32.69 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  33.86 
 
 
361 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.42 
 
 
316 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  33.54 
 
 
361 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  33.54 
 
 
361 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  27.19 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  31.73 
 
 
346 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  31.85 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  30.87 
 
 
334 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  30.87 
 
 
302 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  30.5 
 
 
365 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  30.5 
 
 
365 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  30.5 
 
 
365 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.7 
 
 
943 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  32.24 
 
 
362 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  29.62 
 
 
365 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  29.62 
 
 
365 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.55 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  30.94 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  23.15 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  27.51 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  28.4 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.62 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.51 
 
 
552 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  25.57 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.61 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  26.16 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  30.71 
 
 
386 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.51 
 
 
442 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.93 
 
 
429 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  27.36 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 
384 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  35.78 
 
 
436 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  25.36 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  28.95 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  57.41 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 
421 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.96 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  30.86 
 
 
442 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.7 
 
 
398 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 
444 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  35.48 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  31.86 
 
 
419 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  31.61 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.69 
 
 
428 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  58.97 
 
 
287 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  27.43 
 
 
459 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  24.43 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  32.18 
 
 
431 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>