84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2369 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  35 
 
 		 349 aa  205  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  36.91 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  35.03 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  36.42 
 
 		 372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  37.18 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  32.72 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  35.5 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  35.09 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  35.39 
 
 		 329 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  32.52 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  32.49 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  36.68 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  30.74 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  35.87 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  34.2 
 
 		 334 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  29.97 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  34.58 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  34.89 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  34.58 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  35.26 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  35.26 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  35.54 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  35.54 
 
 		 365 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  35.54 
 
 		 365 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  29.34 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  35.08 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  33.02 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  28.8 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  30.03 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  30.82 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  27.61 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  28.16 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  29.2 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  27.74 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  29.55 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  27.76 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  27.13 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.38 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  28.09 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  29.06 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.14 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  26.23 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  28.3 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  24.85 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  28.27 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  26.07 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.58 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  23.72 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  28.48 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  28.48 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.97 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  24.2 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  20 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  23.99 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  24.18 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  23.44 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  20.73 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  23.57 
 
 		 943 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  22.35 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  21.36 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  21.31 
 
 		 412 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  22.13 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  31.09 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  27.56 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  25.19 
 
 		 276 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  22.58 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  31.3 
 
 		 419 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  23.48 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  27.22 
 
 		 263 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  24.49 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  24.88 
 
 		 398 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  29.41 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  28.87 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  22.36 
 
 		 428 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  23.04 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>