90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1320 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 275 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  95.27 
 
 		 275 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  48.45 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  43.91 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  43.13 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  34.06 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  38.41 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  31.8 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  27.87 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  30.43 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.68 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  28.77 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  24.8 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  28.26 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  29.93 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  26.74 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  23.44 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  26.09 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  25.93 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  31.71 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  26.04 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  25.45 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  25.27 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  22.49 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  27.44 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.11 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  27.78 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  27.08 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  25.94 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  31.46 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  27.08 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  24.25 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  23.83 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  23.83 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  24.44 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  28.37 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  28.37 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  24 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  24 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  25.13 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  21.85 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  24.18 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  26.13 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  28.04 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.05 
 
 		 426 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  25.4 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  26.98 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  28.63 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  25.41 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  26.34 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  22.96 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.27 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  24.55 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  26.76 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  25.8 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  23.38 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  23.64 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  22.36 
 
 		 552 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.1 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  26.28 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  22.11 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  25.78 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  24.45 
 
 		 442 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  23.55 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.64 
 
 		 385 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  24.55 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  24.91 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  25.11 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  23.81 
 
 		 451 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  23.35 
 
 		 319 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  23.35 
 
 		 319 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  22 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.81 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  25.45 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  24.73 
 
 		 412 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  36.46 
 
 		 422 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  24.34 
 
 		 384 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 314 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  30.77 
 
 		 427 aa  42  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  22.16 
 
 		 450 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>