39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1633 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  48.45 
 
 		 275 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  47.66 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  44.92 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  40.78 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  40.62 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  34.63 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  31.54 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  23.99 
 
 		 299 aa  89  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  23.29 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  26.58 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.57 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  30.06 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  24.32 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  21.68 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  24.57 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  25.51 
 
 		 341 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  23.63 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  25.51 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  24.47 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 333 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  26.2 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  21.68 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 		 399 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  24.84 
 
 		 317 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  25.7 
 
 		 384 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  23.92 
 
 		 330 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  26.09 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  25.7 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  21.88 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  30.28 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  27.54 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  26.54 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  23.56 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  23.21 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  22.87 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.06 
 
 		 374 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>