80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2349 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  858    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  54.32 
 
 		 372 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  50.44 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  45.97 
 
 		 329 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  50.44 
 
 		 361 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  49.85 
 
 		 361 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  45.41 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  47.03 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  47.03 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  46.5 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  46.5 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  47.11 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  46.5 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  47.49 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  44.61 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  48.94 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  45.37 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35.03 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  37.39 
 
 		 317 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  35.22 
 
 		 327 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  38.62 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  35.96 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.23 
 
 		 318 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  32 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  28.74 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  34.23 
 
 		 318 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  32.53 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  29.54 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  29.82 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.99 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  28.31 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  27.11 
 
 		 353 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.75 
 
 		 374 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  30.49 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  26.63 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  28.41 
 
 		 344 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  29.28 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  27.91 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.07 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  26.75 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.02 
 
 		 316 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  29.23 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  27.89 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  27.84 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 		 341 aa  93.2  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  28.53 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.13 
 
 		 323 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  26.61 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  26.61 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  26.97 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  24.09 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  26.01 
 
 		 316 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  25.67 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  27.27 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  24.62 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  24.62 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  25.69 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  26.99 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  31.4 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  26.35 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  23.18 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  22.84 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  27.24 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  26.58 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  23.81 
 
 		 943 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  23.21 
 
 		 552 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  24.12 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  26.16 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  22.58 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  19.49 
 
 		 294 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  24.82 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  51.28 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  29.27 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  21.37 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  21.16 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  23.69 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.4 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>