79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1576 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  37.78 
 
 
327 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  39.31 
 
 
318 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  38.73 
 
 
317 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  37.42 
 
 
318 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  36.07 
 
 
326 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  37.82 
 
 
318 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  29.39 
 
 
349 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  32.06 
 
 
338 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  31 
 
 
372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  29.64 
 
 
329 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  36.81 
 
 
336 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  28.1 
 
 
337 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.01 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  34.52 
 
 
344 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  30.18 
 
 
417 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  30.61 
 
 
342 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  36.1 
 
 
333 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  33.22 
 
 
315 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.85 
 
 
334 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  34.58 
 
 
317 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  33.94 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  34.67 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  33.73 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  33.96 
 
 
316 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  34.89 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  34.58 
 
 
341 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  34.26 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.89 
 
 
330 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  34.57 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  30.09 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  33.54 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  29.63 
 
 
361 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  34.44 
 
 
357 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  34.44 
 
 
357 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  29.59 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  29.59 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  29.63 
 
 
361 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  32.62 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  29.63 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  33.82 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  29.25 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  30.31 
 
 
365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  30.31 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  30.31 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  29.65 
 
 
354 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  32.37 
 
 
341 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.87 
 
 
316 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  31.99 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  29.3 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  29.3 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.25 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  32.72 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  30.29 
 
 
346 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.89 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  32 
 
 
314 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.88 
 
 
353 aa  102  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  28.48 
 
 
302 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  27.8 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  23.62 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  29.73 
 
 
943 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  31.02 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  24.25 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  22.89 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.81 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  29.14 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  25.97 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  23.63 
 
 
257 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  30.3 
 
 
564 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  24.79 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  29.2 
 
 
479 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25.21 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  31.58 
 
 
422 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  20.74 
 
 
552 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  24.76 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.44 
 
 
431 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  34.52 
 
 
431 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>