185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1404 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  913    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  63.41 
 
 		 564 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  44.93 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  53.18 
 
 		 415 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  42.47 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  45.41 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  43.53 
 
 		 463 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  45.6 
 
 		 431 aa  279  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  45.87 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  48.4 
 
 		 405 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  35.71 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  38.89 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  40.53 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  36.85 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  35.04 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  35.46 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  35.08 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  31.44 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  30.92 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.73 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  28.54 
 
 		 422 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 		 421 aa  99.8  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.4 
 
 		 552 aa  94  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  31.05 
 
 		 384 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  30.9 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  28.07 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  33.2 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  35.21 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  31.42 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.44 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  28.89 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  33.45 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  32.71 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  34.52 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  30.33 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  31.44 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  22.55 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  33.65 
 
 		 374 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.46 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  36.02 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  29.16 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  31.16 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.48 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  30.54 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.82 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  30.32 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  28.97 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  27.22 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  31.93 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.83 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.53 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.77 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  29.69 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.46 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  27.05 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  25.93 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  25.14 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.13 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.56 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  30.25 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  27.81 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  26.56 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21.88 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  27.51 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  24.15 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.46 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.87 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  29.22 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.46 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  28.85 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  23.92 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.56 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0682  hypothetical protein  29.33 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0197418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  27.09 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  24.66 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  28.89 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.54 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.54 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  22.64 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  27.59 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  29.32 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  50 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.51 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  32.7 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  27.88 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  29.94 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  22.16 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  30.14 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>