243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  883    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  50.26 
 
 
412 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  50.13 
 
 
443 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  47.48 
 
 
421 aa  342  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  47.18 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  45.81 
 
 
394 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  44.68 
 
 
382 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  41.73 
 
 
410 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  36.24 
 
 
395 aa  239  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  35.9 
 
 
453 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  32.25 
 
 
407 aa  195  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  33.19 
 
 
380 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  35.35 
 
 
387 aa  99.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  38.56 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  31.72 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  31.8 
 
 
497 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  32.78 
 
 
431 aa  84  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  32.21 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.14 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  30.23 
 
 
415 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.53 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  36.17 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.85 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  32.34 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  29.63 
 
 
564 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  27.1 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  30 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.94 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  29.19 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  28.73 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  38.41 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  30.82 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27.59 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.19 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  34.07 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  29.7 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  33.57 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  28.49 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  38 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.68 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 
385 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  28.57 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  26.19 
 
 
363 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  26.32 
 
 
463 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  30.43 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  27.66 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  25.95 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  25.95 
 
 
362 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  32.8 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  29.12 
 
 
452 aa  60.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  27.33 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  36.84 
 
 
391 aa  60.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  29.94 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  25.95 
 
 
404 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 
384 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25.95 
 
 
404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  25.78 
 
 
391 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.57 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  27.78 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  28.02 
 
 
317 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.41 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.81 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  50 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  38.46 
 
 
453 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.32 
 
 
404 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  33.61 
 
 
428 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.07 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  24.32 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  39.06 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.1 
 
 
386 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  32.02 
 
 
429 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  24.7 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25.25 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  28.26 
 
 
334 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  28.68 
 
 
326 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.45 
 
 
422 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  39.06 
 
 
434 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  34.18 
 
 
320 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  23.87 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  34.15 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  35.21 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  42.03 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  27.82 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  28.28 
 
 
428 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  29.53 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  34.88 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  34.09 
 
 
308 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  33.06 
 
 
449 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  28.57 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  33.06 
 
 
449 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
453 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  33.06 
 
 
449 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.67 
 
 
384 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  38.46 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>