190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5533 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 375 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  37.9 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  37.18 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  30.6 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  28.8 
 
 		 443 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.72 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  31.78 
 
 		 497 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  29.81 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  35.82 
 
 		 561 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  29.48 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  31.92 
 
 		 453 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 		 421 aa  93.2  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.86 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  37.75 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  25.13 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  35.58 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  31.17 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  32.9 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  34.32 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  34.81 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  31.34 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  28.45 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  30.33 
 
 		 564 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  31.6 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  31.85 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  27.09 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  32.92 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  37.9 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  29.85 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  30.56 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  31.22 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  30.53 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  33.76 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  32.09 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  36.96 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.95 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  29.1 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  36.05 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.92 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  33.06 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  34.72 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  23.86 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  28.8 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  23.86 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  28.74 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  28.74 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  28.88 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  26.75 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  28.09 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  28.21 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  29.7 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  30.13 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  22.89 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  28.63 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  34.41 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  27.57 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  18.93 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  20.83 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  24.56 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  29 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21.12 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.31 
 
 		 302 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  38.36 
 
 		 320 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  38.18 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  35.71 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  37.74 
 
 		 431 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  16.73 
 
 		 432 aa  53.1  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  20.5 
 
 		 433 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  35.71 
 
 		 312 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  25.65 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  32.12 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.22 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  23.72 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.17 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  32.16 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  35.71 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.2 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.41 
 
 		 458 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  29.48 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  21.52 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.03 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.63 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  30.04 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  35.24 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  33.53 
 
 		 452 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  30.47 
 
 		 434 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  32.38 
 
 		 433 aa  49.7  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  26.36 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  28.87 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  28.72 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>