102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3578 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
370 aa  711    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  47.31 
 
 
402 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  36.87 
 
 
325 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 
333 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  31.3 
 
 
552 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  31.73 
 
 
442 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  32.05 
 
 
391 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  28.42 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  30.77 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  31.77 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  34.5 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  27.98 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  33.73 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.09 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.87 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  36.79 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.38 
 
 
444 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  27.27 
 
 
428 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.92 
 
 
443 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 
453 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  27.47 
 
 
497 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 
398 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
450 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  28.53 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  27.31 
 
 
463 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  30.2 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  35.82 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.67 
 
 
458 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  27.18 
 
 
436 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  23.79 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  36.52 
 
 
452 aa  53.5  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  35.51 
 
 
422 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  34.38 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  27.8 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 
426 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  26.6 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  36.49 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  37.11 
 
 
439 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.08 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  33.94 
 
 
491 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  25.62 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  35.92 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.05 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21.48 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  33.62 
 
 
334 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  30.7 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  37.5 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  31.4 
 
 
317 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  25.49 
 
 
433 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.04 
 
 
380 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 
413 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  30.37 
 
 
451 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  22.22 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  35.92 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  29.17 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  33.08 
 
 
444 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  28.82 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  36.28 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  22.92 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  22.14 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  29.71 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  21.57 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  41.41 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  30.28 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  31.85 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  23.74 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 
267 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  30.82 
 
 
428 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  29.82 
 
 
326 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  27.81 
 
 
463 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  31.15 
 
 
428 aa  46.6  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  24.5 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  27.88 
 
 
564 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  25.69 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.88 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  24.6 
 
 
575 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  27.87 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  24 
 
 
385 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  35.05 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  32.69 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  27.53 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  22.02 
 
 
433 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  28.36 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  27.85 
 
 
459 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  30.14 
 
 
429 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  33.96 
 
 
339 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  26.19 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  29.31 
 
 
431 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  28.35 
 
 
479 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  26.19 
 
 
384 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  24.2 
 
 
384 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  31.51 
 
 
341 aa  43.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  31.51 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  28.85 
 
 
453 aa  42.7  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>