25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0817 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  849    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  53.73 
 
 
432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  29.41 
 
 
412 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0940  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  187  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  28.04 
 
 
412 aa  183  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  29.41 
 
 
442 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  26.26 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  24.03 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  22.06 
 
 
426 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  29.77 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.13 
 
 
385 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  20.42 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  20.71 
 
 
426 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  25.21 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  19.31 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  22.44 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  28.77 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  27.49 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  24.16 
 
 
564 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2816  hypothetical protein  31.45 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.64 
 
 
444 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  29.13 
 
 
370 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  38.24 
 
 
443 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>