87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1678 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  92.96 
 
 
412 aa  778    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  829    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  31.39 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  28 
 
 
427 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0940  hypothetical protein  29 
 
 
393 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  29.87 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  23.9 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  23.48 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  25.55 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26 
 
 
564 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  25.27 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.56 
 
 
479 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  25.6 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  31.52 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25.6 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  25.6 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  23.38 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  23.28 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.53 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.6 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.6 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  28.16 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  25.82 
 
 
404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  20.82 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  27.61 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  26.99 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  26.99 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  27.93 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  27.22 
 
 
379 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  22.04 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3072  hypothetical protein  21.57 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0261289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3033  hypothetical protein  21.57 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  26.09 
 
 
418 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  23.68 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  24.74 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  23.97 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  27.4 
 
 
267 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  25.37 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.66 
 
 
422 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  25.12 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3016  hypothetical protein  24.15 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2758  hypothetical protein  21.29 
 
 
369 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3067  hypothetical protein  22.48 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  29.76 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2772  hypothetical protein  21.05 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  25.69 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  24.17 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  23.21 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  26.43 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2755  hypothetical protein  24.39 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00204015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2736  hypothetical protein  24.39 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  23.89 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  23.35 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2823  hypothetical protein  21.38 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3037  hypothetical protein  21.38 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3015  hypothetical protein  24.39 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  24.39 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  24.07 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2816  hypothetical protein  23.2 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  27.55 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  25.57 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.28 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  30.4 
 
 
432 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  21.97 
 
 
380 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  24.15 
 
 
387 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  23.59 
 
 
391 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  23.04 
 
 
398 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2226  hypothetical protein  22.55 
 
 
388 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000308564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  19.46 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  20.16 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0319  hypothetical protein  22.48 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3017  hypothetical protein  23.51 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2804  hypothetical protein  23.51 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  25.2 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  32.61 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  29.25 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  22.5 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  24.67 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  21.74 
 
 
415 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  46.15 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  36.73 
 
 
463 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  24.68 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  28.48 
 
 
389 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  36.73 
 
 
491 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  20.09 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.59 
 
 
458 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>