45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3811 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  786    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  27.55 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  30.07 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  26.54 
 
 
360 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  28.46 
 
 
391 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  24.52 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.32 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  23.9 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  21.94 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  23.79 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.64 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  21.36 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  22.97 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  35.16 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
389 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  23.2 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  24.72 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  20.68 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  26.98 
 
 
462 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  21.09 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.7 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  28.93 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  19.85 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  26.2 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.33 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  23.75 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  25.57 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  28.69 
 
 
473 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  29.46 
 
 
303 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  24.34 
 
 
399 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  34.52 
 
 
434 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.67 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 
426 aa  46.2  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  32.32 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.24 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.26 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  32.58 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  28.46 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  26.77 
 
 
453 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  25.23 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.48 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.16 
 
 
404 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 
430 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  23.19 
 
 
432 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>