176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1710 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
401 aa  801    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  38.1 
 
 
402 aa  296  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  27.27 
 
 
389 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  21.72 
 
 
442 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  21.07 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  27.17 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  23.55 
 
 
428 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  22.18 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  23.84 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  21.7 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  20.25 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  25.78 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  24.56 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  26.56 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  23.21 
 
 
564 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  21.02 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  22.45 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  26.39 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.57 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  21.88 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.24 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  35.66 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  22.63 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  25.12 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  26.06 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.5 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  22.07 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  22.66 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  25.95 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  22.19 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
575 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  23.87 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  20.38 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  26.95 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.61 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  18.95 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  20.9 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  25.78 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  27.42 
 
 
463 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  22.78 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  23.14 
 
 
453 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  20.5 
 
 
432 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  25.64 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  24.48 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.6 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  24.48 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  19.92 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  21.8 
 
 
561 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  25.87 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  22.98 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  18.42 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  25.17 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  20.59 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  21.76 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  23.66 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  22.89 
 
 
552 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  22.17 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  21.7 
 
 
451 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  23.46 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  22.7 
 
 
458 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  18.1 
 
 
497 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  19.24 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  19.24 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  24.27 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  21.62 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  19.62 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  26.12 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  27.21 
 
 
304 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  26.57 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  24.62 
 
 
427 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  22.04 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  23.38 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  20.35 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  23.12 
 
 
463 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  19.76 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  19.24 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  26.4 
 
 
446 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  23.81 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  22.43 
 
 
385 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  20.49 
 
 
447 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 
370 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  25.97 
 
 
528 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  23.98 
 
 
314 aa  53.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.65 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  23.79 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  27.27 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  19.24 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  23.02 
 
 
491 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  20.51 
 
 
431 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>