144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4816 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
453 aa  857    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  42.07 
 
 
431 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  37.72 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  37.92 
 
 
412 aa  230  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  37.07 
 
 
394 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  38.99 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  37.9 
 
 
410 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  38.2 
 
 
382 aa  203  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  34.58 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  35.9 
 
 
442 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.16 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  34.67 
 
 
380 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 
497 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  44.35 
 
 
375 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  33.2 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  35.12 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  31.77 
 
 
561 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  35.55 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  34.9 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  31.27 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  37.57 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  36.41 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  29.51 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  30.14 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  30.1 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  29.49 
 
 
564 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  34.67 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  30.88 
 
 
325 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  32.01 
 
 
422 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  29.93 
 
 
423 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 
463 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  30.84 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  32.31 
 
 
479 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  24.27 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  26.58 
 
 
404 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  34.86 
 
 
452 aa  60.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  32.1 
 
 
439 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 
426 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  25.24 
 
 
384 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  27.39 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.81 
 
 
405 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  26 
 
 
402 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  31.97 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  43.88 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  31.56 
 
 
491 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.38 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  30.79 
 
 
413 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  29.11 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  32.84 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  31.65 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.72 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.3 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  39.45 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  29.58 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.7 
 
 
404 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.1 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 
552 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  33.2 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.75 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.1 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  24.42 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  22.46 
 
 
404 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  26.25 
 
 
451 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  43.28 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  27.91 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  32.41 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  38.82 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.1 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  31.88 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  27.6 
 
 
349 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 
398 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  41.94 
 
 
286 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.07 
 
 
317 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 
384 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 
384 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  41.94 
 
 
289 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  41.94 
 
 
289 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  41.94 
 
 
289 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.58 
 
 
294 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  48.89 
 
 
241 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  41.94 
 
 
286 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  29.7 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  30.16 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  24.84 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.21 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  37.37 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  31.28 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  36.92 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  30.74 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  32 
 
 
473 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  25.47 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  25 
 
 
380 aa  47.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.54 
 
 
444 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  27.73 
 
 
318 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  28.57 
 
 
419 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  27.6 
 
 
385 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  18.64 
 
 
433 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>