252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0686 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 434 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  35.37 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  34.31 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  38.54 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  44.84 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  34.2 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  35.48 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  32.46 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  35.23 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  32.37 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  31.85 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  39.29 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  35.98 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  34.88 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  32.25 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  31.96 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  30.66 
 
 		 408 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  30.66 
 
 		 408 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  33.19 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.2 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  29.59 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  30.27 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.85 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  32.58 
 
 		 641 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 638 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.49 
 
 		 310 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.91 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.57 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  31.54 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  31.28 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  29.44 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.56 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.79 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.96 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.02 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  33.09 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.53 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  34.03 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.5 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.41 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.64 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.36 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  29.72 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.82 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.68 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  25.53 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.82 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 		 530 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  27.46 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.46 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.56 
 
 		 317 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  30.36 
 
 		 652 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.74 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  32.54 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25.27 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.32 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.62 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  37.6 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.32 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  31.47 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.09 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.64 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.67 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  31.71 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  29.06 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  31.65 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  31.58 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  27.63 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.77 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  33.1 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.67 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.42 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  31.35 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  31.75 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  28.42 
 
 		 330 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  23.86 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.76 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  31.93 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  37.78 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  32.9 
 
 		 316 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  41.54 
 
 		 341 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  31.69 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.98 
 
 		 295 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.31 
 
 		 331 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.29 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  24.23 
 
 		 298 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  20.4 
 
 		 296 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.69 
 
 		 303 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.4 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  28.69 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.55 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2154  protein of unknown function DUF58  28.28 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.690685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>