167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2913 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  87.98 
 
 
391 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  35.13 
 
 
380 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  33.75 
 
 
497 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  35.77 
 
 
375 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  37.98 
 
 
395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  37.91 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  43.35 
 
 
422 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  34.63 
 
 
421 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  39.11 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  40.32 
 
 
374 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  36.05 
 
 
418 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  36.27 
 
 
431 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  32.73 
 
 
394 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  38.99 
 
 
439 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  38.86 
 
 
405 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  36.4 
 
 
431 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  38.14 
 
 
431 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  32.99 
 
 
564 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  29.66 
 
 
443 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.46 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  35.29 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  37.96 
 
 
415 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  34.58 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  30.86 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  34.08 
 
 
382 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  32.13 
 
 
432 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  31.03 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  33 
 
 
561 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  35.71 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  32.81 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  40 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  36.03 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  30.25 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  34.02 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  35.98 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  35.1 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.48 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  34.62 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.59 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  30.73 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  32.24 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  30.73 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  23.66 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  36.13 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27.84 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  34.25 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  29.52 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 
491 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  30.36 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.26 
 
 
469 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.93 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  27.98 
 
 
463 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  28.73 
 
 
448 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  32.08 
 
 
546 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  32.27 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  23.43 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  36.89 
 
 
453 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  29.79 
 
 
426 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.42 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  39.44 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  35.14 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  27.18 
 
 
419 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 
370 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  26.48 
 
 
422 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  34.27 
 
 
430 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
430 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 
362 aa  56.2  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  29.81 
 
 
453 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.12 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.49 
 
 
267 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.97 
 
 
432 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  26.87 
 
 
828 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  26.51 
 
 
425 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  39.47 
 
 
393 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  29.79 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.73 
 
 
458 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  32.81 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  35.34 
 
 
473 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.77 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  32.81 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  29.26 
 
 
441 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  32.81 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  28.87 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  46.03 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.23 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  20.97 
 
 
443 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  29.1 
 
 
641 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  30.25 
 
 
340 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.84 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  30.9 
 
 
455 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  28.75 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 
505 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  31.18 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>