148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5777 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 429 aa  829    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  57.48 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  44.66 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  41.61 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  41.24 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  41.26 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  43.85 
 
 		 424 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  44.52 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  45.65 
 
 		 431 aa  252  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  46.81 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  38.97 
 
 		 564 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  40.57 
 
 		 479 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  43.57 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  42.86 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  39.66 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  38.81 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  35.48 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  29.58 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  33.48 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  27.4 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  32.59 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  32.08 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  36.29 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  31.69 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  30.43 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  35.37 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  33.22 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  28.61 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.06 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.89 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  37.99 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  30.21 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.76 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  33.96 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  33.84 
 
 		 374 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.62 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.79 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  35.76 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  27.91 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  32.47 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  30.92 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  35.18 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  26.87 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  29.39 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  32.99 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  36.75 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  31.05 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  30.98 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  23.94 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  36.36 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  32.86 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  33.5 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.27 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.11 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  36.18 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.17 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  25.49 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.3 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  27.07 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  26.54 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  34.91 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  29.27 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  34 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  34 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  34 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  31.79 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  20.81 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.94 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.71 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  31.65 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  28.45 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  29.27 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2804  hypothetical protein  28.21 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3017  hypothetical protein  28.21 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  29.58 
 
 		 455 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  28.36 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2736  hypothetical protein  28.21 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  28.9 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  28.21 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3015  hypothetical protein  28.21 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.89 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  28.21 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  30.82 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  25.77 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  35.65 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2755  hypothetical protein  27.56 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  32.62 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  27.57 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>