186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3233 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  847    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  88.4 
 
 		 431 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  55.48 
 
 		 432 aa  461  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  50.71 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  49.41 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  50.12 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  50.72 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  52.32 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  46.15 
 
 		 479 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  44.69 
 
 		 564 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  43.2 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  40.29 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  45.65 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  38.71 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  38.81 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  37.89 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  37.06 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  31.13 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  35.02 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  33.18 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  35.92 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  35.83 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  35.41 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  31.14 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  38.53 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  31.35 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  32.38 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  29.91 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  33.77 
 
 		 393 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  37.75 
 
 		 561 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  29.8 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  33.07 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  26.23 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  30.45 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  31.73 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  26.44 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  31.95 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  36.87 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.47 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.31 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.5 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  34.31 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  31.46 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  28.8 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  29.28 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.6 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  29.92 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  29.93 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.21 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  28.16 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  32.21 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.08 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  29.67 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  28.92 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  32.1 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  18.54 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  29.47 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  26.37 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  26.37 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  29.53 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  33.55 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  23.91 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.83 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  29.95 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.41 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  29.39 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  32.47 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.46 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  24.46 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.46 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.27 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.01 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.46 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.77 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.75 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  28.81 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  23.78 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.98 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  31.52 
 
 		 334 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  27.48 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  28.84 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  23.91 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  24.52 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  23.91 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  26.02 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  23.37 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.06 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>