126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1150 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
395 aa  733    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  40.12 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  39.08 
 
 
387 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  36.75 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  36.67 
 
 
380 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  34.52 
 
 
497 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  38.46 
 
 
561 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  33.1 
 
 
463 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  34.32 
 
 
375 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  37.99 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  35.4 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  32.87 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  34.51 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  40.97 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
453 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  36.17 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  35.71 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  35.8 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  35.43 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  31.33 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  27 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  34.93 
 
 
491 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  33.86 
 
 
394 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  34.62 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  37.89 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  28.2 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  29.37 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  35.46 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.19 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  29.39 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  29.19 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  31.19 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  37.02 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  33.45 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  32.53 
 
 
479 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  29.57 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  38.18 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  36.72 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.35 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  38.76 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  29.96 
 
 
564 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  33.75 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  45.95 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  36.28 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  32.03 
 
 
391 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  46.09 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  19.83 
 
 
401 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  29.05 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  36.08 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  33.54 
 
 
412 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  26.34 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.35 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  34.07 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  32 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  41.38 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 
444 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.12 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.28 
 
 
448 aa  53.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  28.12 
 
 
386 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  30.4 
 
 
290 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  26.87 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  30.87 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.43 
 
 
291 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  29.58 
 
 
552 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  34.31 
 
 
316 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  40.38 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  29.91 
 
 
469 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  33.93 
 
 
453 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  27.83 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.57 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  28.95 
 
 
458 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  34.33 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.04 
 
 
295 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  33.66 
 
 
444 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  65.62 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  29.36 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.28 
 
 
295 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  28.26 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.79 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  26.37 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.45 
 
 
295 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  36.7 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  20.7 
 
 
444 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  28 
 
 
391 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  34.18 
 
 
419 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1427  hypothetical protein  44.19 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0646612  hitchhiker  0.0048399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  28.66 
 
 
444 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.57 
 
 
447 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.51 
 
 
293 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  31.73 
 
 
306 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  28.75 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  30.77 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  26.4 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  28.57 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  54.29 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  36 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  33.09 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>