33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1427 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1427  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  832    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0646612  hitchhiker  0.0048399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  53.85 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  36.96 
 
 
369 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  27.17 
 
 
316 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  28 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  29.82 
 
 
424 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  30.51 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.57 
 
 
440 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  36.79 
 
 
442 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  27.03 
 
 
432 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.79 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  44.19 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  39.39 
 
 
295 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  38.1 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  35.85 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  58.06 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  51.43 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  45.45 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  35.85 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  46.51 
 
 
291 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  29.47 
 
 
357 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  43.18 
 
 
295 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  33.04 
 
 
453 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.67 
 
 
303 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.37 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  26.76 
 
 
392 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  30.93 
 
 
519 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  41.86 
 
 
431 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  44.44 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.67 
 
 
303 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>