85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1988 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  586  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  40.6 
 
 
313 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  35.58 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.8 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  32.47 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.24 
 
 
308 aa  79  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  26.02 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  28.1 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  27.62 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  27.62 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  27.62 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  30.41 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  31.55 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.51 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
444 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  52.54 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.04 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.36 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.82 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 
446 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 
303 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.86 
 
 
443 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  28.14 
 
 
404 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  23.46 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.44 
 
 
444 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.47 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  34.82 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  26.7 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.34 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.61 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  28.9 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  21.27 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.76 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.35 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.73 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  34.04 
 
 
455 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.03 
 
 
448 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  28.67 
 
 
380 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.92 
 
 
294 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.47 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  23.83 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  35.48 
 
 
391 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  32.2 
 
 
489 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.6 
 
 
443 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  39.68 
 
 
296 aa  47  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  29.87 
 
 
469 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.11 
 
 
443 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  32.8 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  24.77 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  23.96 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.35 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  24.69 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.87 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  43.9 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  43.64 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  22.85 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1427  hypothetical protein  46.51 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0646612  hitchhiker  0.0048399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  35.38 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.4 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.22 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  25.69 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  24.35 
 
 
440 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  25.93 
 
 
436 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.57 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  24.43 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  40.62 
 
 
519 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.71 
 
 
440 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  23 
 
 
429 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  25.14 
 
 
443 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  25.98 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  38.89 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.23 
 
 
444 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  35.14 
 
 
575 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  34.92 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.6 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  30.93 
 
 
458 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  22.89 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>