280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1085 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
519 aa  1048    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  41.34 
 
 
489 aa  335  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  36.82 
 
 
473 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2154  protein of unknown function DUF58  38.56 
 
 
482 aa  300  5e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.690685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  31.72 
 
 
287 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.39 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  31.51 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  26.57 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  22.01 
 
 
432 aa  67  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.15 
 
 
300 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  19.82 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.38 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  28.67 
 
 
320 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.73 
 
 
300 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.17 
 
 
299 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  32 
 
 
308 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 
295 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  39.71 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  35.29 
 
 
331 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  35.29 
 
 
331 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  43.94 
 
 
311 aa  60.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.36 
 
 
287 aa  60.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  33.07 
 
 
290 aa  60.5  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  24.11 
 
 
432 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  21.94 
 
 
433 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  31.58 
 
 
287 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  27.44 
 
 
308 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  31.3 
 
 
575 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  37.66 
 
 
306 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  36.76 
 
 
319 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  30.84 
 
 
296 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.5 
 
 
331 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.15 
 
 
291 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  41.1 
 
 
357 aa  58.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  28.17 
 
 
325 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  22.67 
 
 
433 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25 
 
 
443 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  26.99 
 
 
425 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  33.98 
 
 
295 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.65 
 
 
328 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.85 
 
 
444 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  25.52 
 
 
393 aa  57  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  56.6  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  32.79 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  37.5 
 
 
341 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  31.53 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  38.89 
 
 
334 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.07 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  28.21 
 
 
312 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.78 
 
 
458 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.91 
 
 
328 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  28.21 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  33.67 
 
 
296 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  26.83 
 
 
308 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  32.14 
 
 
286 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.87 
 
 
296 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.94 
 
 
288 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.12 
 
 
340 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 
444 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.91 
 
 
296 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
302 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.36 
 
 
292 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  37.5 
 
 
302 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  32.05 
 
 
306 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 
292 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  31.9 
 
 
286 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  28.47 
 
 
318 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.32 
 
 
309 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 
302 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  25.75 
 
 
429 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  28.45 
 
 
313 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  40.3 
 
 
302 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  35.62 
 
 
288 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.19 
 
 
335 aa  53.9  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 
302 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.85 
 
 
418 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  20.61 
 
 
384 aa  53.9  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  29.14 
 
 
443 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  38.03 
 
 
433 aa  53.5  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  29.7 
 
 
443 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  21.88 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  31.78 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  32.63 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  22.13 
 
 
434 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  33.07 
 
 
315 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 
391 aa  53.5  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  33.07 
 
 
315 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 
297 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  33.07 
 
 
315 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  41.1 
 
 
316 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  31.06 
 
 
302 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  39.44 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  34.21 
 
 
320 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  36.21 
 
 
291 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  30.7 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  32.26 
 
 
317 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  27.35 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>