138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3412 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
455 aa  850    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  50.73 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  48.12 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  44.95 
 
 
435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  37.01 
 
 
430 aa  227  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  44.84 
 
 
434 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  33.18 
 
 
466 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  32.28 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  33.89 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  30.48 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  31.84 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  33.58 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  34.47 
 
 
404 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  36.02 
 
 
423 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  37.79 
 
 
520 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  32.94 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  32.94 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  32.77 
 
 
405 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  33.2 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  38.41 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  32.97 
 
 
641 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  31.7 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  31.48 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  29.72 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  31.44 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  23.12 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.52 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  29.25 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  34.29 
 
 
298 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  31.02 
 
 
638 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  33.51 
 
 
575 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  28.91 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  34.81 
 
 
300 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 
528 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  32.08 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  32.14 
 
 
310 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.37 
 
 
288 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  22.6 
 
 
308 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  26.84 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  30.12 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.94 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.47 
 
 
340 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.78 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.67 
 
 
310 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.83 
 
 
309 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.52 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.84 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  32.13 
 
 
380 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.54 
 
 
290 aa  53.9  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.26 
 
 
287 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.82 
 
 
300 aa  53.9  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  31.34 
 
 
442 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 
446 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  28.9 
 
 
684 aa  53.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 
444 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  29.19 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  32.14 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.36 
 
 
290 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.64 
 
 
291 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 
340 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  33.13 
 
 
321 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.03 
 
 
291 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  33.47 
 
 
638 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  28.67 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.19 
 
 
296 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
489 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  27.76 
 
 
546 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  38 
 
 
312 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  28.37 
 
 
308 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  30.36 
 
 
433 aa  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  29.61 
 
 
458 aa  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  30.05 
 
 
311 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.94 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  31 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  25.96 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  27.91 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  30.2 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  31.18 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  32.93 
 
 
430 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  33.64 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  35.37 
 
 
331 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  31.78 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.47 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 
296 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  33.63 
 
 
312 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  27.62 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.23 
 
 
295 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  34.04 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 
295 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  35.94 
 
 
308 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  32.02 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  27.96 
 
 
447 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  31.03 
 
 
312 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 
304 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>