195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3075 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
520 aa  1017    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  34.34 
 
 
405 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  33.5 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  33.02 
 
 
408 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  33.02 
 
 
408 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  33.72 
 
 
408 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  33.57 
 
 
404 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  29.38 
 
 
429 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  33.33 
 
 
466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  33.96 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  35.81 
 
 
415 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  32.21 
 
 
459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  30.63 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  34.88 
 
 
434 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  28.88 
 
 
431 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  28.23 
 
 
391 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  30.46 
 
 
450 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  37.79 
 
 
455 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  34.48 
 
 
446 aa  94.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  32.64 
 
 
419 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  33.06 
 
 
435 aa  93.2  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 
638 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  30.31 
 
 
430 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  32.49 
 
 
641 aa  87  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  30.24 
 
 
419 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  29.26 
 
 
287 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  33.7 
 
 
448 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  28.35 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  28.52 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  33.07 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  28.94 
 
 
546 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.51 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  31.02 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  30.56 
 
 
638 aa  73.6  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  29.84 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  29.66 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  36.52 
 
 
828 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
436 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  34.23 
 
 
575 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27.91 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
292 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.36 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.73 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  32.33 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  28.14 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.64 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.65 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  28.54 
 
 
429 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25.95 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  27.01 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.52 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.57 
 
 
436 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
296 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.67 
 
 
428 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.03 
 
 
293 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.52 
 
 
328 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 
446 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.41 
 
 
300 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.05 
 
 
290 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.06 
 
 
297 aa  62  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.12 
 
 
295 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.32 
 
 
303 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.1 
 
 
309 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.38 
 
 
290 aa  60.5  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.99 
 
 
458 aa  60.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.74 
 
 
287 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.72 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.18 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.12 
 
 
286 aa  60.1  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  30.16 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  29.63 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  27.57 
 
 
469 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.2 
 
 
291 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  29.39 
 
 
443 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  29.51 
 
 
436 aa  57.4  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.53 
 
 
296 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 
302 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.36 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.46 
 
 
443 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  26.33 
 
 
469 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.22 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  29.03 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.72 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.67 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  28.91 
 
 
436 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.16 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.41 
 
 
287 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  30.89 
 
 
443 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.17 
 
 
447 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  42.65 
 
 
430 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  44.12 
 
 
430 aa  53.9  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 
432 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  29.67 
 
 
431 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  24.43 
 
 
419 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.78 
 
 
300 aa  53.5  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>