227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0034 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  100 
 
 
451 aa  890    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  48.08 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  45.89 
 
 
469 aa  346  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  49.34 
 
 
641 aa  340  4e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  42.79 
 
 
684 aa  338  8e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  44.95 
 
 
528 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  44.58 
 
 
638 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  42.05 
 
 
652 aa  296  5e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  39.47 
 
 
505 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  40.44 
 
 
638 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  34.58 
 
 
487 aa  240  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  40.12 
 
 
828 aa  230  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  35.39 
 
 
436 aa  212  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  34.71 
 
 
445 aa  206  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  33.49 
 
 
530 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  32 
 
 
445 aa  187  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  34.84 
 
 
546 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.77 
 
 
419 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.3 
 
 
419 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.08 
 
 
391 aa  87  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  29.89 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  30.47 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  31.44 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  27.2 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  25.59 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.13 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  28.87 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  28.87 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  29.41 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.39 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.23 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  28.87 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.68 
 
 
436 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.94 
 
 
296 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  26.01 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  27.2 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  27.96 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  26.01 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  25.81 
 
 
391 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  25.69 
 
 
467 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.85 
 
 
440 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.44 
 
 
296 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  25.51 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.82 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.02 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.52 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.47 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  26.01 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.22 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.43 
 
 
287 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.82 
 
 
328 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  26.63 
 
 
286 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  30.16 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.64 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 
292 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.01 
 
 
295 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  25.43 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.32 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.12 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  23.97 
 
 
395 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  25.43 
 
 
362 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.44 
 
 
308 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.92 
 
 
330 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.23 
 
 
443 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  25 
 
 
429 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  39.24 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.6 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  44.44 
 
 
294 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  25.43 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.61 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  22.4 
 
 
446 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  27.9 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.22 
 
 
296 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
446 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  25.09 
 
 
422 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  27.84 
 
 
385 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  26.4 
 
 
404 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.67 
 
 
288 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  43.33 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  29.82 
 
 
287 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.81 
 
 
287 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.7 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.11 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  27.35 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.91 
 
 
391 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  24.75 
 
 
459 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.61 
 
 
296 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.52 
 
 
287 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.09 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  27.81 
 
 
336 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  28.46 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.96 
 
 
297 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  26.77 
 
 
444 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>