186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1173 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  100 
 
 
469 aa  924    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  50.34 
 
 
448 aa  371  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  47.7 
 
 
528 aa  354  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  51.43 
 
 
641 aa  340  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  45.31 
 
 
684 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  46.17 
 
 
451 aa  331  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  43.67 
 
 
638 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  41.88 
 
 
652 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  42.69 
 
 
638 aa  271  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  36.23 
 
 
505 aa  256  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  41.16 
 
 
828 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  34.95 
 
 
436 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  37.43 
 
 
445 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 
530 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  39.23 
 
 
487 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  36.24 
 
 
546 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  33.49 
 
 
445 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  31.4 
 
 
419 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  30.4 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  28.83 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.24 
 
 
444 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.7 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.08 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.7 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.56 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25.14 
 
 
404 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.58 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.58 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.13 
 
 
458 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  30.62 
 
 
434 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  30.8 
 
 
418 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  28.46 
 
 
466 aa  60.1  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  24.69 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.58 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.17 
 
 
443 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  30.18 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  25.51 
 
 
330 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  28.38 
 
 
395 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  29.12 
 
 
385 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.58 
 
 
410 aa  56.6  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  31.1 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  27.46 
 
 
467 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  29.28 
 
 
391 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  24.05 
 
 
331 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  25.83 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  22.51 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  32.92 
 
 
404 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  32.75 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 
444 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  28.14 
 
 
424 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  29.68 
 
 
449 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  32.69 
 
 
473 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  25.69 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  32.14 
 
 
295 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  32.47 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  30.81 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  30.81 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  30.81 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  24.6 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  30.84 
 
 
432 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  19.93 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  24.41 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  33.62 
 
 
444 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  35.9 
 
 
405 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.69 
 
 
440 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.92 
 
 
463 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.93 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  24.53 
 
 
320 aa  50.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  32.17 
 
 
454 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  39.08 
 
 
393 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.08 
 
 
296 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  26.29 
 
 
317 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  30.17 
 
 
432 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 
302 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  22.87 
 
 
429 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  26.18 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  32.71 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  30.99 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  27.14 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  26.77 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  38.24 
 
 
310 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  22.92 
 
 
380 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  40.74 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  33.64 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  25.09 
 
 
318 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  28.89 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  30 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.71 
 
 
317 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  30.38 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  31.25 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  30.43 
 
 
430 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.2 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  32.74 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  23.36 
 
 
309 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>