178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1650 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
463 aa  915    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  53.98 
 
 
418 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  46.77 
 
 
432 aa  362  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  48.95 
 
 
431 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  52.04 
 
 
415 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  49.65 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  48.79 
 
 
422 aa  335  7e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  48.05 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  51.33 
 
 
405 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  45.89 
 
 
564 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  43.68 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  40.28 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  40.71 
 
 
429 aa  259  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  39.42 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  40.77 
 
 
453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  36.53 
 
 
392 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  30.57 
 
 
463 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  39.09 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  31.89 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  38.81 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  36.46 
 
 
391 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  33.68 
 
 
380 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.6 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  35.31 
 
 
411 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  34.45 
 
 
497 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  32.62 
 
 
384 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  31.41 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  36.82 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  28.98 
 
 
419 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  32.84 
 
 
412 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  25.36 
 
 
391 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  30.9 
 
 
453 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  29.62 
 
 
407 aa  87.8  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  35.43 
 
 
395 aa  87.4  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  29.43 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 
384 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  32.41 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  28.1 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  30.6 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.73 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  29.92 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  34.84 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  28.18 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.81 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  31.98 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  30 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  27.59 
 
 
384 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.33 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  31.67 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  28.62 
 
 
410 aa  73.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  28.57 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.85 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  29.8 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  29.88 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  23.91 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  32.8 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  32.47 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  32.63 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.84 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.97 
 
 
412 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.55 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  25.95 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  23.77 
 
 
405 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.28 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  36.84 
 
 
340 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.91 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.03 
 
 
458 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  29.44 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.28 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.54 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.7 
 
 
444 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.54 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  23.67 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.91 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  29.36 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  29.07 
 
 
394 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  20.33 
 
 
402 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  23.78 
 
 
404 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  26.21 
 
 
436 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 
505 aa  60.1  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  31.75 
 
 
334 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3213  protein of unknown function DUF58  29.74 
 
 
371 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0779405  normal  0.18342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  20.43 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  26.32 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  30.43 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.52 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  25.37 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  35.03 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.14 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 
370 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  25.89 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>