188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1944 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
445 aa  882    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  50.93 
 
 
546 aa  348  9e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  37.91 
 
 
445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  38.07 
 
 
436 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  35.7 
 
 
530 aa  222  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  32.9 
 
 
505 aa  200  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  36.07 
 
 
641 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  35.28 
 
 
448 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  32 
 
 
451 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  33.57 
 
 
528 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  33.26 
 
 
469 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  32.71 
 
 
652 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  31.09 
 
 
638 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  32.39 
 
 
684 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  37.12 
 
 
487 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  32.2 
 
 
828 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  33.71 
 
 
638 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.93 
 
 
419 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  29.08 
 
 
419 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  29.04 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  25.49 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  28.12 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.55 
 
 
287 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  28.83 
 
 
405 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.88 
 
 
405 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  28.22 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  28.83 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  28.22 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.74 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  28.22 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  27.61 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  27.61 
 
 
362 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.64 
 
 
458 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.5 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  32.26 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  29.26 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  25.38 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 
309 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  28.37 
 
 
309 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.21 
 
 
440 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.36 
 
 
296 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.52 
 
 
300 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.86 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  25 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  21.23 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.2 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  35.66 
 
 
305 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  23.65 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 
302 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  29.68 
 
 
404 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
340 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  31.03 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.63 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  28.21 
 
 
318 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  27.91 
 
 
308 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  31.03 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  31.03 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  41.18 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.08 
 
 
295 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  32.2 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.2 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.07 
 
 
287 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.75 
 
 
436 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1748  hypothetical protein  27.88 
 
 
289 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  25.76 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  29.17 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  38.75 
 
 
454 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  30.92 
 
 
437 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  32.65 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
450 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.12 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  48 
 
 
430 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  26.95 
 
 
311 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  33.68 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  30.66 
 
 
430 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  30.63 
 
 
239 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  29.74 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
312 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  33.68 
 
 
317 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  33.68 
 
 
317 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  33.68 
 
 
317 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.32 
 
 
314 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  39.51 
 
 
328 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  33.68 
 
 
317 aa  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  42 
 
 
444 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.47 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  33.04 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  29.32 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  23.9 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.12 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.03 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  23.86 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.93 
 
 
287 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 
292 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  29.55 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  31.85 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>