More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0461 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  37.96 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.09 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.24 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.64 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.47 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.97 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  36.07 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.34 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.78 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  33.64 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.16 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.23 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  28.94 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.2 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.74 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  32.12 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.72 
 
 		 340 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  33.74 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  31.06 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.83 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.04 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 		 340 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  29.49 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.9 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.45 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  32.88 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.29 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.73 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.91 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  29.23 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.71 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  29.32 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  26.54 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  31.34 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  28.51 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.6 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.57 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  28.98 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.22 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.24 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.24 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.41 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  31.72 
 
 		 519 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  28.29 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  29.02 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  28.88 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  30.89 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.94 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  30.63 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  34.82 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  27.8 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  25.12 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  27.31 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  32.2 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  28.44 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.54 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  32.42 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.88 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  27.13 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.31 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  25.66 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.83 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.83 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.83 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.46 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  33.18 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  32.63 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  26.56 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  31.43 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.63 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.71 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  34.38 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  28.28 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  34.38 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  28.92 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.5 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  27.69 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  26.36 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  30.16 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  28.7 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.24 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  29.61 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.68 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.99 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>