86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1526 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  43.21 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  48.23 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  41.07 
 
 
287 aa  201  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  43.68 
 
 
280 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  41.79 
 
 
290 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  39.35 
 
 
282 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  40.14 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  45.36 
 
 
283 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  41.16 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  40.14 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  39.24 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  39.93 
 
 
284 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  37.06 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  40.97 
 
 
294 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  37.67 
 
 
296 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  39.07 
 
 
291 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  38.08 
 
 
287 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  30.71 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  34.89 
 
 
284 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  31.34 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.11 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.78 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.79 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.71 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.05 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.23 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  21.77 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.52 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.33 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  31.28 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.11 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.5 
 
 
328 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.24 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.04 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.46 
 
 
340 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.67 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.96 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.29 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.71 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.14 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.9 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.66 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.54 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.4 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  20.61 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.91 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.12 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  26.92 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  26.46 
 
 
363 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  29.46 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.32 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.11 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  22.61 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.62 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  26.38 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  32.03 
 
 
323 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.29 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.35 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  22.78 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  24.5 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  24.78 
 
 
286 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.56 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  29.96 
 
 
393 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  28.26 
 
 
335 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  24.77 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.41 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  24.02 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  24.3 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.13 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  26.12 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.67 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  34.15 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  28.32 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.81 
 
 
328 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  34.57 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.06 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>