44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2998 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  39.05 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  32.49 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  34.33 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  37.92 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  35.32 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  35.36 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  32.61 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  34.46 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  34.83 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  33.93 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  32.71 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  35.14 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  30.31 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  32.04 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  28.39 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  27.18 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  28.15 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  29.07 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  27.82 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.1 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.47 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.12 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.62 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.12 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  21.84 
 
 		 290 aa  48.9  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.68 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  28.25 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  21.77 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.23 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.02 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  29.08 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.91 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.45 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  25.62 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.24 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  24.68 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.42 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  29.55 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  28.28 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.22 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  34.94 
 
 		 418 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>