71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3277 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  68.17 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  65.31 
 
 		 287 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  60.42 
 
 		 289 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  59.12 
 
 		 296 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  41.03 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  39.24 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  39.86 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  40.97 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  36.77 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  38.85 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  38.49 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  31.72 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  37.41 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  38.43 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  35.92 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  38.75 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  35.86 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  28.67 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.35 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.65 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.85 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.66 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.07 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.62 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  29.73 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.32 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.36 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.75 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.21 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.72 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.03 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.78 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.11 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.4 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.15 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  30.68 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.75 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  25.48 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.04 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.44 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  19.85 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  24.75 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.8 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  33.8 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  29.6 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  29.39 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.19 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  29.95 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  29.01 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  20.69 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  29.01 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  25.98 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  28.71 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  22.62 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  24.89 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  26.22 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  29.81 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  28.91 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  31.03 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.95 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  26.87 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>