49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4145 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  96.54 
 
 		 289 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  88.58 
 
 		 289 aa  477  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  72.3 
 
 		 284 aa  362  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  58.12 
 
 		 283 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  48.57 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  50.91 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  41.52 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  40.94 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  42.12 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  41.85 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  41.35 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  40.36 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  36.12 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  37.28 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  37.33 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  37.54 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  38.49 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  32.22 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  35.69 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.59 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  28.05 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.18 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.85 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  36.79 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  23.63 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.6 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.63 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.4 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.7 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.23 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.92 
 
 		 340 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.41 
 
 		 353 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.85 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.6 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33.94 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.52 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.63 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  31.43 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.2 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.42 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>