53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4627 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  88.58 
 
 		 289 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  89.27 
 
 		 289 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  72.3 
 
 		 284 aa  362  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  55.23 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  49.26 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  48.96 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  40.07 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  40.88 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  40.71 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  42.07 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  39.86 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  41.76 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  35.79 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  36.46 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  35.84 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  37.14 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  37.41 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  31.37 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  34.2 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.27 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.52 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.4 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.79 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.22 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  23.02 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.84 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.82 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.79 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.23 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  30.39 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33.78 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.64 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  25.48 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.94 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  23.83 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.39 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  33.04 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  23.41 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.35 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29.55 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  30.97 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.52 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  30.97 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  30.97 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  33.85 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  28.81 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  30.29 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  31.28 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.8 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>