64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0784 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  47.29 
 
 
284 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  40.58 
 
 
286 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  43.68 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  38.71 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  40.57 
 
 
290 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  40.43 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  39.01 
 
 
291 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  39.86 
 
 
294 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  43.01 
 
 
287 aa  175  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  38.75 
 
 
282 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  40.88 
 
 
289 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  36.01 
 
 
296 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  39.64 
 
 
284 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  40.51 
 
 
289 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  34.66 
 
 
287 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  41.35 
 
 
289 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  40.67 
 
 
291 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  38.49 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  32.83 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.95 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.76 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  21.76 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.69 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.81 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.71 
 
 
290 aa  62.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  21.49 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.56 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.09 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.05 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.35 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.33 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.4 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.04 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 
329 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  24.75 
 
 
328 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  23.48 
 
 
309 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.27 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 
340 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.73 
 
 
287 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.94 
 
 
353 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  23.77 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.73 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  26.39 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.52 
 
 
363 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.52 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.1 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.14 
 
 
296 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.17 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.11 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  24.55 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.46 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  24.79 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  26.15 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27 
 
 
315 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27 
 
 
315 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27 
 
 
315 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  29.52 
 
 
325 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>