70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8035 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  58.12 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  57.75 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  57.4 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  55.23 
 
 		 289 aa  262  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  51.34 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  46.76 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  45.36 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  43.27 
 
 		 284 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  37.72 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  38.49 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  35.87 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  38.95 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  39.01 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  37.63 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  39.79 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  35.21 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  34.02 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  30.83 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  35.64 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.78 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  33.49 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.02 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.96 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.37 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  29.39 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.04 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.79 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.09 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.86 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.49 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.32 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  31.5 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.48 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.89 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  33.19 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  30.55 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.47 
 
 		 353 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.74 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  30.87 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  32.9 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.79 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.88 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.98 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  32.57 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.51 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  35.32 
 
 		 339 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.8 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.48 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.25 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  31.94 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.52 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  34.78 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  35.5 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  27.27 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.95 
 
 		 444 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  21.81 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.22 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  27.54 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  30.87 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  29.44 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  31.11 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>