105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1824 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  560  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  45.39 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  40.57 
 
 
280 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  40.14 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  34.49 
 
 
286 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  41.07 
 
 
289 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  35.34 
 
 
287 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  40.36 
 
 
289 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  39.48 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  34.89 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  37.76 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  38.89 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  34.6 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  37.23 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  32.86 
 
 
289 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  32.86 
 
 
291 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  29.03 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  32.25 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.81 
 
 
293 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.91 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.56 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.22 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.63 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.47 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.83 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.32 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.41 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.73 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.28 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.83 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.34 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.45 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.49 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.79 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.73 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  27.76 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.15 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.55 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.71 
 
 
340 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.35 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.47 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  32.24 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  23.93 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.34 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  20.74 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.51 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  31 
 
 
351 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  28.33 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  30.48 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  29 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  29.78 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.33 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  32.16 
 
 
393 aa  53.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  25.47 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.45 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  26.79 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.53 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
303 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.37 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.24 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  27.9 
 
 
363 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.85 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  27.06 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.37 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.96 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  25.11 
 
 
302 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.97 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.12 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.31 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  30.04 
 
 
341 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.36 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.34 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.22 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  30.94 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.67 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.14 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  29.1 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 
306 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  27.48 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  41.94 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  29.13 
 
 
443 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  28.98 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  27.31 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  29.41 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  31.86 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.04 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.47 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  25.99 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  31.17 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>