More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0547 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  47.19 
 
 
303 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  45.57 
 
 
304 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  41.97 
 
 
322 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  39.13 
 
 
309 aa  249  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  41.36 
 
 
298 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  40.92 
 
 
299 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  43.38 
 
 
309 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  40.6 
 
 
303 aa  232  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  35 
 
 
308 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  43.55 
 
 
302 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  43.87 
 
 
302 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  43.23 
 
 
302 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  43.97 
 
 
306 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  37.58 
 
 
300 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  34.84 
 
 
302 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  32.34 
 
 
295 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.31 
 
 
291 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.89 
 
 
300 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  34.02 
 
 
295 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.76 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  26.78 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.02 
 
 
295 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.53 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  27.92 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  31.41 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.85 
 
 
293 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  27.04 
 
 
292 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.45 
 
 
340 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  31.01 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.92 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.16 
 
 
293 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 
302 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.23 
 
 
297 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  27.56 
 
 
291 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.91 
 
 
290 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
306 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.8 
 
 
295 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.49 
 
 
296 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.11 
 
 
309 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  33.68 
 
 
288 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  29.73 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.48 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  30.19 
 
 
292 aa  99  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  25.61 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  32.37 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.57 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.21 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.08 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.24 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.58 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.4 
 
 
283 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  34.21 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.42 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.73 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.61 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.13 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25.84 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.74 
 
 
303 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  28.35 
 
 
303 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 
298 aa  86.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.33 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.53 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  27.44 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  26.86 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  28.29 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.7 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  28.62 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.25 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.05 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  28.37 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  28.21 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.43 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.51 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  27.61 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.08 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  28.24 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  30.22 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  29.3 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  34.01 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  28.83 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  25.68 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  25.91 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  21.72 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.92 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  23.08 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  26.61 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  28.7 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  23.16 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.19 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  28.03 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.57 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>