More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1661 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  675    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  50.81 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  49.85 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  49.61 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  47.64 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  41.5 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  37.71 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  48.29 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  45.22 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  42.35 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  45.53 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  42.23 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  36.82 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  43.46 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  45.11 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  36.49 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  42.58 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  39.87 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  43.59 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  36.58 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  36.24 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  41.2 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  35.39 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  36.15 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  44.78 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  44.78 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  44.78 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  45.69 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  39.39 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  35.18 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  39.39 
 
 		 314 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  36.6 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  42.74 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  35.91 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  35.57 
 
 		 312 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  43.64 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  42.67 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  32.48 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  38.14 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  41.15 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  35 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.37 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  35.66 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  36.07 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  29.84 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  35.66 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  35.45 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  38.32 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  36.86 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.08 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.28 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  30.93 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  30.69 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.21 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  36.41 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  28.95 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.36 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.66 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.9 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.87 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  31.11 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.67 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.46 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.21 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.84 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.52 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.62 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  31.01 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.17 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 		 302 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.77 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.17 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.77 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.83 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 292 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.34 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.03 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  28.35 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  26.27 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.36 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  26.69 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  35.09 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33.04 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.51 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.84 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  29.1 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  34.03 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  27.19 
 
 		 276 aa  89.4  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  25.17 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>