More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1248 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  642    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  32.41 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  33.79 
 
 		 287 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  37.25 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  31.51 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  36.17 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  30.98 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  31.8 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  34.47 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  31.96 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  34.68 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  32.95 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.83 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  35.89 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.14 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.94 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  31.32 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  32.61 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  29.92 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.09 
 
 		 363 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.43 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.1 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  29.28 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  37.45 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.66 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  32.37 
 
 		 296 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  28.12 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.01 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.42 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.24 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  29.85 
 
 		 287 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30.54 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  30.54 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.54 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.97 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.83 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  30.42 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.05 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.15 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.17 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.2 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.9 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.2 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  29.43 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.66 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.9 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.8 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.44 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  30.16 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.6 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  25.78 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  26.69 
 
 		 418 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  35.94 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  31.84 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  26.21 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  28.51 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  26.5 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.56 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  26.88 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  28.95 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.72 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  26.67 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.2 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  24.6 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.38 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  27.07 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  32.29 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  29.34 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  29 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  25.67 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.09 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  31.76 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  25.32 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  29.3 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  28.5 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.31 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  30.51 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  40.2 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  28.75 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  26.49 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  31.18 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  25.4 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  22.96 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.61 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>