248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1136 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  630  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  89.88 
 
 		 338 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  58.94 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  60.54 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  53.14 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  53.14 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  53.14 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  55.03 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  56.27 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  54.28 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  53.47 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  51.29 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  56.25 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  53.95 
 
 		 317 aa  252  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  55.37 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  50.17 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  52.17 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  52.91 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  51.33 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  50.91 
 
 		 339 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  54.67 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  49.38 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  52.82 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  53 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  41.08 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  39.35 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  40.98 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  41.72 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  39.24 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  40.47 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  37.63 
 
 		 295 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  41.4 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  40.14 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.07 
 
 		 287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  36.33 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.36 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.12 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  29.07 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  35 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.36 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.81 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.03 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  32.52 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.81 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.4 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.23 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.17 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.37 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  35.38 
 
 		 418 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25.58 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.84 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.95 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.31 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.43 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  24.65 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.93 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  23.63 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  23.31 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.06 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.38 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.34 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  28.38 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.84 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  31.88 
 
 		 334 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.54 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.07 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  27.33 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  26.42 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  23.76 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  33.18 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  36.24 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.33 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  26.37 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  31.65 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.33 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.92 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.4 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.04 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.53 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.21 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.22 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.7 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  29.27 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  26.86 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.02 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.39 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.95 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  27.46 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  24.67 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  26.48 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>