250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2378 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  60.83 
 
 
338 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  63.51 
 
 
311 aa  338  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  56.71 
 
 
323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  58.78 
 
 
322 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  57.56 
 
 
338 aa  295  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  53.07 
 
 
315 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  53.07 
 
 
315 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  53.07 
 
 
315 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  58.14 
 
 
350 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  56.91 
 
 
366 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  56.27 
 
 
328 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  55.22 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  53.11 
 
 
316 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  55.74 
 
 
350 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  51.38 
 
 
312 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  55.14 
 
 
302 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  52.56 
 
 
317 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  48.6 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  53.54 
 
 
334 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  52.6 
 
 
331 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  49.83 
 
 
310 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  49.84 
 
 
339 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  38.54 
 
 
340 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  38.56 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  40.82 
 
 
309 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  34.23 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  35.35 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  38.8 
 
 
363 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  38.21 
 
 
328 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  38.56 
 
 
353 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  38.41 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.44 
 
 
291 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.81 
 
 
292 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.7 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.95 
 
 
287 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.19 
 
 
290 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33.43 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.43 
 
 
287 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.62 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.69 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.82 
 
 
290 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.27 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.17 
 
 
302 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.74 
 
 
294 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.58 
 
 
295 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 
294 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 
296 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.21 
 
 
296 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.83 
 
 
296 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  25.31 
 
 
328 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
292 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.44 
 
 
345 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.62 
 
 
295 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.39 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.17 
 
 
296 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.98 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.87 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  24.72 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  29.43 
 
 
287 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  26.47 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  26.14 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  89.7  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  27.01 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  24.91 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.4 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  31.2 
 
 
358 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.17 
 
 
294 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  27.7 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.77 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.51 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.47 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.04 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.94 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.51 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  32.3 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  28.27 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  27.36 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.71 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.01 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.67 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.35 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  25.63 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  27.97 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.12 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  27.27 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.78 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  30.8 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  28.67 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  32.03 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.16 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.7 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.09 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>