262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2316 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  47.58 
 
 		 329 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  48.34 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  47.33 
 
 		 328 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  49.05 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  44.06 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  38.83 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  36.69 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.11 
 
 		 291 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.08 
 
 		 295 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  33.15 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.78 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.88 
 
 		 295 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  35.13 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.63 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  32.8 
 
 		 310 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  33.77 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  35.11 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  33.05 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  36.22 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.23 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.85 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  33.51 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  32.71 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  32.71 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  32.71 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  24.58 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  35.51 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  32.84 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  32.49 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.04 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  33.87 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  33.55 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  33.24 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.55 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.89 
 
 		 288 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  33.12 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  35.59 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  113  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.08 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  32.98 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 		 297 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.28 
 
 		 292 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.9 
 
 		 314 aa  98.6  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  32.92 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.14 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  48.31 
 
 		 294 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  25.66 
 
 		 306 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  46.07 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.35 
 
 		 296 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  21.69 
 
 		 291 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.73 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  22.37 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  22.79 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  50.56 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.29 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  26.57 
 
 		 314 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.48 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  26.57 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  25.27 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  26.57 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  26.61 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  20.17 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  40.7 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.34 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  22.64 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  27.86 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  26.54 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.34 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.34 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  25.27 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  22.95 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  44.93 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  45.63 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  47.83 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  26.59 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  27.41 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  49.28 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  25.35 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  44.93 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.17 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  25.09 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  29.29 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  39.6 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  24.15 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  26.57 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  36.44 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  25.66 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  22.16 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  44.93 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  36.9 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  44.93 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>